Campus Comenius beschikt niet over een eigen parking voor wagens, maar er is voldoende parkeerplaats in de omliggende straten en de stadsparking onder het Martelarenplein ligt vlakbij. Je fiets kan je plaatsen aan de fietsstallingen vlak voor het gebouw.
Alle studenten kunnen bovendien gebruikmaken van de ondergrondse parking op Campus Vesalius, op nauwelijks tien minuutjes stappen van Campus Comenius. Automobilisten dienen bij het binnenrijden van de parking een ticket te nemen. Betaling - enkel met proton - gebeurt via een betaalautomaat vóór het verlaten van Campus Vesalius. Het aantal plaatsen is evenwel beperkt (±100).
